Notion du Next generation sequencing NGS

Whole genome shotgun sequencing

Une approche aléatoire du séquençage du génome basée sur le cisaillement de l'ADN génomique, suivie du clonage, du séquençage et de l'assemblage de l'ensemble du génome, aboutissant finalement à une séquence génomique annotée et finie. Le séquençage de génomes entiers peut également être réalisé par un séquençage séquentiel à l'aide d'un fusil à pompe d'un ensemble de grands clones d'insertion se chevauchant.

shotgun sequencing

Biopuces à ADN

Réseaux miniaturisés contenant des milliers de fragments d'ADN représentant des gènes dans une zone de quelques centimètres carrés. Ces «puces» servent principalement à surveiller l'expression des génomes au niveau de l'ARN messager.

Microarray dna

Bioinformatique

La bioinformatique est l'informatique biologique, en particulier l'analyse assistée par ordinateur des séquences du génome et des données expérimentales. Cette approche consiste à étudier le génome ou le protéome, on parle de génomique si l'étude porte sur l'ensemble du génome ou de tous les gènes d'un organisme. En revanche, la protéomique est l'étude du complément protéique ou protéome d'un organisme.